MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-5

Total Repeats: 578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017398	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387826860
2	NC_017398	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387826860
3	NC_017398	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387826860
4	NC_017398	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826860
5	NC_017398	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826860
6	NC_017398	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826860
7	NC_017398	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826860
8	NC_017398	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826860
9	NC_017398	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	387826860
10	NC_017398	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387826860
11	NC_017398	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826860
12	NC_017398	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387826860
13	NC_017398	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826860
14	NC_017398	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826860
15	NC_017398	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826860
16	NC_017398	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826860
17	NC_017398	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	387826860
18	NC_017398	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826860
19	NC_017398	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826860
20	NC_017398	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826860
21	NC_017398	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387826860
22	NC_017398	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826860
23	NC_017398	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826860
24	NC_017398	T	6	6	1058	1063	0 %	100 %	0 %	0 %	387826860
25	NC_017398	AGT	2	6	1230	1235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826860
26	NC_017398	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826860
27	NC_017398	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826860
28	NC_017398	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826860
29	NC_017398	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826861
30	NC_017398	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826861
31	NC_017398	TTA	2	6	1382	1387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826861
32	NC_017398	ATGA	2	8	1468	1475	50 %	25 %	25 %	0 %	387826861
33	NC_017398	ATT	2	6	1530	1535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826861
34	NC_017398	TAG	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826861
35	NC_017398	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	387826861
36	NC_017398	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	387826861
37	NC_017398	ATT	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826861
38	NC_017398	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826861
39	NC_017398	AATT	2	8	1893	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	387826861
40	NC_017398	GTAA	2	8	1921	1928	50 %	25 %	25 %	0 %	387826861
41	NC_017398	ACAA	2	8	1934	1941	75 %	0 %	0 %	25 %	387826861
42	NC_017398	AAG	2	6	1971	1976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826861
43	NC_017398	TGAG	2	8	2011	2018	25 %	25 %	50 %	0 %	387826862
44	NC_017398	A	6	6	2049	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	387826862
45	NC_017398	GCA	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826862
46	NC_017398	GAG	2	6	2224	2229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826862
47	NC_017398	ACA	2	6	2253	2258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826862
48	NC_017398	GAT	2	6	2286	2291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826862
49	NC_017398	TGGCA	2	10	2327	2336	20 %	20 %	40 %	20 %	387826862
50	NC_017398	G	6	6	2439	2444	0 %	0 %	100 %	0 %	387826862
51	NC_017398	GAA	2	6	2514	2519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826862
52	NC_017398	GT	3	6	2539	2544	0 %	50 %	50 %	0 %	387826862
53	NC_017398	CAAG	2	8	2682	2689	50 %	0 %	25 %	25 %	387826863
54	NC_017398	AATT	2	8	2783	2790	50 %	50 %	0 %	0 %	387826863
55	NC_017398	A	6	6	2915	2920	100 %	0 %	0 %	0 %	387826863
56	NC_017398	GTG	2	6	2938	2943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826863
57	NC_017398	TA	4	8	2969	2976	50 %	50 %	0 %	0 %	387826863
58	NC_017398	ATGT	2	8	3019	3026	25 %	50 %	25 %	0 %	387826863
59	NC_017398	TAA	2	6	3128	3133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826863
60	NC_017398	TTA	2	6	3142	3147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826863
61	NC_017398	TGG	3	9	3155	3163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826863
62	NC_017398	TAAT	2	8	3175	3182	50 %	50 %	0 %	0 %	387826863
63	NC_017398	AATT	2	8	3209	3216	50 %	50 %	0 %	0 %	387826863
64	NC_017398	T	6	6	3215	3220	0 %	100 %	0 %	0 %	387826863
65	NC_017398	CAAGCT	2	12	3243	3254	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387826863
66	NC_017398	A	6	6	3264	3269	100 %	0 %	0 %	0 %	387826863
67	NC_017398	AGT	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826863
68	NC_017398	ACA	2	6	3392	3397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826864
69	NC_017398	GCA	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826864
70	NC_017398	T	6	6	3515	3520	0 %	100 %	0 %	0 %	387826864
71	NC_017398	AAG	2	6	3615	3620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826864
72	NC_017398	GAA	2	6	3668	3673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826864
73	NC_017398	CTA	2	6	3720	3725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826864
74	NC_017398	TAAAG	2	10	3781	3790	60 %	20 %	20 %	0 %	387826864
75	NC_017398	TAA	2	6	3805	3810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826864
76	NC_017398	A	6	6	3825	3830	100 %	0 %	0 %	0 %	387826864
77	NC_017398	ATG	2	6	3903	3908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826864
78	NC_017398	T	7	7	3909	3915	0 %	100 %	0 %	0 %	387826864
79	NC_017398	AAT	2	6	3954	3959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826864
80	NC_017398	A	6	6	3974	3979	100 %	0 %	0 %	0 %	387826865
81	NC_017398	ATT	2	6	3984	3989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826865
82	NC_017398	TGA	2	6	3990	3995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826865
83	NC_017398	ATT	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826865
84	NC_017398	TACAA	2	10	4229	4238	60 %	20 %	0 %	20 %	387826865
85	NC_017398	TCT	2	6	4258	4263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826865
86	NC_017398	TAA	3	9	4302	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826865
87	NC_017398	AGT	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826865
88	NC_017398	ATCA	2	8	4366	4373	50 %	25 %	0 %	25 %	387826865
89	NC_017398	TTCAA	2	10	4395	4404	40 %	40 %	0 %	20 %	387826865
90	NC_017398	A	6	6	4413	4418	100 %	0 %	0 %	0 %	387826865
91	NC_017398	CTT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826865
92	NC_017398	GAA	2	6	4477	4482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826865
93	NC_017398	TC	3	6	4539	4544	0 %	50 %	0 %	50 %	387826865
94	NC_017398	TGA	2	6	4560	4565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826865
95	NC_017398	ATG	2	6	4579	4584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826865
96	NC_017398	TTC	2	6	4629	4634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826865
97	NC_017398	TCC	2	6	4644	4649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826865
98	NC_017398	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826865
99	NC_017398	AGA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826865
100	NC_017398	TTAT	2	8	4757	4764	25 %	75 %	0 %	0 %	387826865
101	NC_017398	AGTA	2	8	4798	4805	50 %	25 %	25 %	0 %	387826865
102	NC_017398	GCT	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826865
103	NC_017398	CTA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826865
104	NC_017398	AGTT	2	8	4933	4940	25 %	50 %	25 %	0 %	387826865
105	NC_017398	GAA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826866
106	NC_017398	TTA	2	6	5015	5020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826866
107	NC_017398	TTAC	2	8	5147	5154	25 %	50 %	0 %	25 %	387826866
108	NC_017398	GTT	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826866
109	NC_017398	GAATTT	2	12	5225	5236	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826866
110	NC_017398	A	6	6	5246	5251	100 %	0 %	0 %	0 %	387826866
111	NC_017398	TGAACT	2	12	5263	5274	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826866
112	NC_017398	ATT	2	6	5277	5282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826866
113	NC_017398	TAG	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826866
114	NC_017398	GAA	2	6	5303	5308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826866
115	NC_017398	G	6	6	5317	5322	0 %	0 %	100 %	0 %	387826866
116	NC_017398	TG	3	6	5402	5407	0 %	50 %	50 %	0 %	387826866
117	NC_017398	TAA	2	6	5417	5422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826866
118	NC_017398	AT	3	6	5447	5452	50 %	50 %	0 %	0 %	387826867
119	NC_017398	TGT	2	6	5511	5516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826867
120	NC_017398	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826867
121	NC_017398	AG	3	6	5543	5548	50 %	0 %	50 %	0 %	387826867
122	NC_017398	TTA	2	6	5585	5590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826867
123	NC_017398	TGG	2	6	5834	5839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826868
124	NC_017398	TAG	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826868
125	NC_017398	AT	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	387826868
126	NC_017398	AAT	2	6	5943	5948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826868
127	NC_017398	TA	3	6	5952	5957	50 %	50 %	0 %	0 %	387826868
128	NC_017398	CTA	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826868
129	NC_017398	AAGT	2	8	6083	6090	50 %	25 %	25 %	0 %	387826868
130	NC_017398	GTA	2	6	6100	6105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826868
131	NC_017398	GCA	2	6	6111	6116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826868
132	NC_017398	TTG	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826868
133	NC_017398	AAT	2	6	6251	6256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826869
134	NC_017398	ATC	2	6	6285	6290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826869
135	NC_017398	GCT	2	6	6311	6316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826869
136	NC_017398	ATA	2	6	6326	6331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826869
137	NC_017398	AT	4	8	6428	6435	50 %	50 %	0 %	0 %	387826869
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